10 июня CE 2007 00:42

> Лю, поправь товарисча где он не прав :-)

В целом прав, но информации там гораздо больше. Есть кстати и полная версия, с пояснениями на английском. Раза в два длиннее. Тоже могу куда-нибудь выложить.

> 0:09-0:14 - кровеносный сосуд, видно, как пробегают эритроциты и лимфоциты.

Угу.

> 0:16-0:31 - мембрана одной из эндотелиальных клеток стенки сосуда.

Нет, это скорее всего как раз мембрана одного из лейкоцитов катящихся по стенке сосуда. Весь фильм это своего рода история о том, что должно произойти в клетке чтобы она перестала катиться и остановилась на одном месте. С 0:16 по 0:22 показывают как он катиться: рецепторы на мембране лейкоцитов постоянно сцепляются с рецепторами на мембране клетки сосуда, а затем расцепляются. Потом камера идет вниз, показывают мембрану лейкоцита - липидное "море" в котором плавают белки. В частности показывают липидные островки, имеющие иную плотность благодаря холестеролу - еще когда я учился о них ничего не знали.

> 0:32-0:42 - рискну предположить, что это микрофиламенты (сократимые
> структуры, лежат как раз под мембраной, как и показано, и определяют
> форму клетки).

Теперь камера идет под мембрану и, насколько я понимаю (в полном фильме это не обсуждается) здесь смешали три клеточных типа дабы показать разнообразие цитоплазматических структур. Сразу как только камера проходит под мембрану в кадре на 0:31 и 37-41 показывают классическую структуру обратной стороны мембраны эритроцита. У лейкоцита такого нет. А дальше камера начинает скользить вниз и мы видим жесткий каркас актиновых филаментов связанных поперечными стяжками (0:42-51) - это уже классическая структура микроворсинки клеток всавывающего эпителия, у лейкоцитов и эритроцитов такой жесткой структуры тоже нет.
В 0:51-1:02 мы видим стремительное образование актиновых филаментов, которые наряду с микротрубочками и промежуточными филаментами, образуют цитоскелет клетки. Молекулы глобулярного актина формируют спирально-организованную нить актина фибрилярного. Процесс перехода глобулярного актина в фибрилярный очень быстр и определяет и подвижность клетки, и ее форму и много чего еще. Кроме того, актин есть и в ядре - чем я собственно говоря и занимаюсь, но там у него иные функции.
В минуту и две секунды приходит какой-то (много их, не знаю точно какой) актин-связывающий белок - "разрезает" нить, после чего происходит стремительная деполимеризация актина в глобулярную форму.

> 1:02-1:07 - образование микротрубочки цитоскелета (опорной структуры в
> клетке). Ну и разрушение её, потом.

Вот с минуты ноль семи и до 14-ти действительно показывают рост и разрушение микротрубочки. Микротрубочки структуры полярные - с одного конца растут, с другого разрушаются в отличие от актиновых нитей которые ведут себя как захотят. Кроме того микротрубочки куда более стабильны - грубо говоря микротрубочка это жесткий каркас клетки, а фибрилярный актин - скелет мобильный и легкий.
В минуту 15-ть на экране появляются главный красавец фильма - динеин, один из молекулярных моторов связаных с микротрубочками. Динеин тащит РНП(комплексы РНК с белками)-частицы и везикулы от разрушающегося конца микротрубочки к растущему, а второй мотор - кинезин наоборот, от плюса к минусу.

> 1:27-1:34 - нам показывают клеточный центр и отходящие от него
> микротрубочки. По микротрубочке ползёт лизосома - см. ниже.

Ага, центр организации микротрубочек.

> 1:38-2:05 - биосинтез белка. Два жёлтых комочка - это две субъединицы
> рибосомы. Между ними проходит нить мРНК, а извивающаяся снизу ниточка -
> это и есть синтезируемый белок.

Угу. На 33-й секунде показывают ядерную мембрану с ядерными порами, через которых транспортируются молекулы мРНК. Молекулы "кэпированы" - один конец особым образом помечен (масштабы, конечно, почти нигде не выдержаны ну да ладно). С этим концом связывается малая субъединица рибосомы, проскальзывает вдоль нити до старового кодона трансляции (синтеза белка) и останавливается там пока не придет большая субъединица. Начинается синтез. Потом синтезированный белок может быть узнан другим и направлен, скажем в митохондрию (1:52 - 1:57). Это синтез белка на "полисомах" в цитоплазме, белок также может синтезироваться прямо в цистерны эндоплазматического ретикулума (ЭПР) который показывают с 1 минуты 59 секунд. Правда на деле это происходит несколько сложнее - в этом случае после начала трансляции к рибосоме подходит особый белковый комплекс, который временно блокирует трансляцию и тащит рибосому на ЭПР.
Начиная с 2:05 показывают как везикулы с синтезированными белками отделяются от ЭПР, чтобы соединиться с цистернами комплекса Гольджи в следующей сцене, а на переднем плане гордо вышагивает динеин.

> 2:15-2:20 - пластинчатое тело, оно же аппарат Гольджи. Показано, из чего
> он образуется: на нижней стороне (полюс регенерации) пузырьки сливаются
> в пластинки, на верхней (полюс секреции) - отрываются.

Угу, а внутри происходит модификация и сортировка белков - какие-куда.

> 2:21 - 2:40 - экзоцитоз. Лизосома доползла до плазматической мембраны и
> извергла своё содержимое (мусор, уже не нужный клетке) наружу.

Верно, хотя это скорее всего не лизосома - а просто везикула. Белки, которые были в везикуле высвобождаются - и скорее всего выполняют некие функции вне клетки, а вот те, что были на мембране везикулы оказываются частью клеточной мембраны - под ними сразу собирается липидный "плотик", что вызывает активацию рецепторов. Те расправляются, связываются с рецепторами эпителиальных клеток сосуда и лейкоцит останавливается, чтобы затем расплющиться и пропозти между клеток эпителия.
Вот такая маленькая история :)

Л.

09 июня CE 2007 23:13

> > Люкс, огромное спасибо! Ролик в торрентах сделал фурор: 37 скачиваний за первые 2 часа! :-) в комментах один биолог расписал "что же вы собственно видели". Пересмотрел раза 4. Показал - гораздо больше... блин, вот не было в наше время такого материала в школах.
>
> Да, это уже не просто фильм - а подлинная реклама молекулярной биологии, чтобы туда народ рвался :)
>

#126341 || selfdisciple (Опытный пользователь) || 2007-06-07 21:08:19

Круто! Спасибо, очень понравилось. Я не специалист, но если кому интересно, вот что я понял (за исправленные ошибки буду премного благодарен):

0:09-0:14 - кровеносный сосуд, видно, как пробегают эритроциты и лимфоциты.
0:16-0:31 - мембрана одной из эндотелиальных клеток стенки сосуда.
0:32-0:42 - рискну предположить, что это микрофиламенты (сократимые структуры, лежат как раз под мембраной, как и показано, и определяют форму клетки).
1:02-1:07 - образование микротрубочки цитоскелета (опорной структуры в клетке). Ну и разрушение её, потом.
1:27-1:34 - нам показывают клеточный центр и отходящие от него микротрубочки. По микротрубочке ползёт лизосома - см. ниже.
1:38-2:05 - биосинтез белка. Два жёлтых комочка - это две субъединицы рибосомы. Между ними проходит нить мРНК, а извивающаяся снизу ниточка - это и есть синтезируемый белок.
2:15-2:20 - пластинчатое тело, оно же аппарат Гольджи. Показано, из чего он образуется: на нижней стороне (полюс регенерации) пузырьки сливаются в пластинки, на верхней (полюс секреции) - отрываются.
2:21 - 2:40 - экзоцитоз. Лизосома доползла до плазматической мембраны и извергла своё содержимое (мусор, уже не нужный клетке) наружу.
2:45-2:58 лимфоцит (одна из немногих клеток у многоклеточных животных, способных вот так ползать, подобно амёбе) проползает между клетками эндотелия (???).

#126350 || selfdisciple (Опытный пользователь) || 2007-06-07 21:25:35
Некоторые пояснения к мембране. Торчащие и соприкасающиеся ниточки - это "хвосты" молекул фосфолипидов. Сами молекулы лежат в два слоя (хорошо видно) и, собственно, образуют эту мембрану. А комочки и пластинки - это белки. Они могут сидеть внутри, т.е. между слоями, а могут и скользить по поверхности. В общих чертах, это современная теория биологических мембран, суть которой в начале ролика и показали.

Лю, поправь товарисча где он не прав :-)

08 июня CE 2007 17:20

> Люкс, огромное спасибо! Ролик в торрентах сделал фурор: 37 скачиваний за первые 2 часа! :-) в комментах один биолог расписал "что же вы собственно видели". Пересмотрел раза 4. Показал - гораздо больше... блин, вот не было в наше время такого материала в школах.

Да, это уже не просто фильм - а подлинная реклама молекулярной биологии, чтобы туда народ рвался :)

Кстати, части показанного материала не только в школе - но даже и в универе быть не могло. О липидных островках, которые там показывают, когда я учился еще никто не знал - их существование в лучшем случае предполагалось, а сейчас их даже выделять научились. Да и структура глобулярного и фибрялярного актина тоже стала известна только в начале 90-х, гордо вышагивающий в фильме по микротрубочкам кинезин вряд ли был открыт раньше середины 80-х, а уж кристалическая структура его стала известна наверняка еще лет через десять.

Л.

08 июня CE 2007 14:13

> Народ! Кто может потратить 50 метров траффика - скачайте http://rapidshare.com/files/30613499/The_Inner_Life_of_the_Cell.avi оно того стоит. Очень красиво сделанная анимация показывающая молекулярную организацию живой клетки.
>
> Л

Люкс, огромное спасибо! Ролик в торрентах сделал фурор: 37 скачиваний за первые 2 часа! :-) в комментах один биолог расписал "что же вы собственно видели". Пересмотрел раза 4. Показал - гораздо больше... блин, вот не было в наше время такого материала в школах.

P.S. есть предположение что ролик появится скоро на уроках не в одной местной школе :-)